Análisis De Datos De Secuenciación Másiva

Este curso forma parte del Programa de Posgrado en Ciencias de la Vida y se imparte junto con investigadores del programa de Biotecnología Marina Dr Miguel Martinez, Dr. Pavel Galindo Torres

Que se aborda en el curso

• Introducción a las tecnologias de secuenciación de segunda y tercera generación
• Introducción a UNIX/LINUX
• Control de cálidad de datos de secuenciación (FASTQC y MULTIQC)
• Ensamble de RNA-seq (Trinity)
• Análisis de genes expresados diferencialmente (Kallsito, RSEM, DESeq2 y EdgeR)
• Homologia de genes, ontología génica y enriquecimiento funcional (Blast, Trinotate, TopGO, DAVID, STRING)
• Secuenciación masiva de genes marcadores (Qiime, DADA)